DNA-Sequenzierung

Dieser Kurs wird auf Deutsch gehalten

Die Kursorganisation erfolgt in Kooperation mit

Inhalte & Lernziele

In diesem Kurs bekommen Sie einen vollständigen Überblick über den Bereich der DNA-Sequenzierung in Theorie und Praxis. Wir stellen Ihnen die historische Entwicklung des DNA-Sequenzierens sowie die Möglichkeiten moderner HTS-Sequenziercenter und die Grundlagen des Next Generation Sequencing (NGS) vor. Sie erfahren alles darüber, wie Sie eine eigene Sequenziereinheit aufbauen und gegebenenfalls auftretende Probleme mit schwierigen oder komplexen Sequenzierproben bewältigen. Die Inhalte des Kurses konzentrieren sich zunächst auf die Sequenzierung von Proben wie z.B. Plasmiden und PCR-Produkten. Sie bearbeiten im Praxisteil den gesamten Prozess von der template-Präparation über die Sequenzierung bis zur Auswertung der Sequenzen mit gängigen Softwaremodulen und verfügbaren Internet-Datenbanken.

Themen des Theorie-Seminars

• Entwicklung der Sequenzierung

• Grundlagen der PCR und DNA-Sequenzierung

• Geräte-Übersicht am Markt

• Präparation und Aufreinigung des Sequenziertemplates

• Sequenzieren schwieriger templates: Tricks und Tipps
  

• Grundlagen des Next Generation Sequencings
  

• Auswertung der Rohdaten
  

• Analyse einfacher Elektropherogramme

• Sequenzen aus gemischten klinischen Proben (ripseq)
  

Themen der Praxis-Schulung

• Primer Removal

• Mengenbestimmung des Templates

• Isolation von DNA-Fragmenten aus Agarosegelen

• Die Sequenzierungsreaktion: PCR-Produkt und Fragment (BandPick^TM-System)

• Bedienung eines Kapillar-Sequenzierers am Beispiel des CEQ 8000

• Auswertung der Ergebnisse mit den Programmen Chromas und ripseq

Zielgruppe

Technische und wissenschaftliche MitarbeiterInnen mit grundlegenden Vorkenntnissen in der Molekularbiologie oder PCR.

Termine und Preis

Anmeldungen für offene Kurse sind derzeit Corona-bedingt noch nicht möglich. Eine Reservierung kann per E-Mail erfolgen. 

Schulungsort: Bremen

Kurssprache: Deutsch

Termin 2023: Corona-bedingt noch nicht festgelegt - der genannte Termin ist ein Platzhalter.

Die Kursgebühr bei offenen Schulungen beinhaltet die Verpflegung während des Kurses (Kaffee, Getränke, Mittagessen), sowie Schulungsunterlagen im Farbdruck und ein Teilnahme-Zertifikat nach GMP-Vorgaben.